Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMC1P11047 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms