Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C8orf89P0DMQ9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms