Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC166P0CW27 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC166P0CW27 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms