Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM228BP0C875 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms