Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
HLA-DQB1P01920 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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