Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms