Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MTSS1O43312 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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