Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
O00370 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
O00370 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
O00370 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
O00370 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
O00370 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
O00370 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
O00370 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
O00370 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
O00370 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms