Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PCH4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PCH4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E9PCH4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E9PCH4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E9PCH4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E9PCH4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E9PCH4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E9PCH4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms