Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms