Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDY1Q9Y6F8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms