Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms