Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPA4Q9UI42 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CPA4Q9UI42 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms