Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms