Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC17A7Q9P2U7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms