Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAPAQ9P0L0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms