Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPHK2Q9NRA0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms