Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
FANCFQ9NPI8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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