Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms