Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms