Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLF1Q9BQI6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms