Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RIT2Q99578 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIT2Q99578 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms