Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC97Q96F63 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC97Q96F63 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms