Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF31Q96EP0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms