Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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RABGGTAQ92696 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGGTAQ92696 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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