Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP34Q70CQ2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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