Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC9A4Q6AI14 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC9A4Q6AI14 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms