Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RFX4Q33E94 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFX4Q33E94 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RFX4Q33E94 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms