Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P3H1Q32P28 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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