Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSPP1Q1MSJ5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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