Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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ZNF56Q15929 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ZNF56Q15929 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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