Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA6Q15825 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA6Q15825 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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