Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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BRD3Q15059 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRD3Q15059 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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