Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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