Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APOFQ13790 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOFQ13790 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOFQ13790 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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APOFQ13790 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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APOFQ13790 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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APOFQ13790 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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APOFQ13790 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOFQ13790 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOFQ13790 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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