Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432.2 ms