Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP140Q13342 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP140Q13342 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP140Q13342 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SP140Q13342 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SP140Q13342 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SP140Q13342 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SP140Q13342 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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