Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNIP1Q12981 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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BNIP1Q12981 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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BNIP1Q12981 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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BNIP1Q12981 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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