Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAF2Q12933 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms