Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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CNTN1Q12860 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CNTN1Q12860 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CNTN1Q12860 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CNTN1Q12860 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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