Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RELAQ04206 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RELAQ04206 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RELAQ04206 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RELAQ04206 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms