Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPARDQ03181 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms