Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUCB1Q02818 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms