Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSG1Q02413 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms