Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHC1P78364 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHC1P78364 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms