Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ARF3P61204 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF3P61204 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms