Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIP4K2AP48426 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms