Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GRIK1P39086 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms