Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms