Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PSMB9P28065 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms